合成生物學(xué)作為催動(dòng)原創(chuàng)突破、學(xué)科交叉融合的前沿學(xué)科,已成為繼發(fā)現(xiàn)DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)所催生的分子生物學(xué)革命、人類基因組計(jì)劃實(shí)施所催生的基因組學(xué)革命之后的第三次生物技術(shù)革命,被《自然》《科學(xué)》等國際頂尖期刊及多國智庫評(píng)為十大顛覆性技術(shù)之一,已成為新一輪科技與產(chǎn)業(yè)革命的前沿焦點(diǎn),各國競(jìng)相在這一領(lǐng)域制定發(fā)展路線圖。
隨著生命科技(BT)與信息科技(IT)的融合發(fā)展,合成生物學(xué)將人類帶入了設(shè)計(jì)、創(chuàng)造生命,繼而走向“物質(zhì)自由”的全新階段,有望改變傳統(tǒng)的生產(chǎn)方式。如今,在人工智能的引領(lǐng)與賦能下,合成生物學(xué)走到了一個(gè)至關(guān)重要的發(fā)展關(guān)口,一些指向未來的創(chuàng)新“核爆點(diǎn)”正在形成。
這一顛覆性技術(shù)、革命性思維將引發(fā)怎樣的變革?在上海市中國工程院院士咨詢與學(xué)術(shù)活動(dòng)中心日前舉行的合成生物學(xué)專題院士沙龍上,中國工程院院士楊勝利、中國科學(xué)院院士丁奎嶺分別作了學(xué)術(shù)報(bào)告,從不同角度介紹合成生物學(xué)即將開啟的未來“造物時(shí)代”所面臨的機(jī)遇與挑戰(zhàn)。
——編者
合成科學(xué)是分子創(chuàng)制的核心和基礎(chǔ),包含化學(xué)合成和生物合成兩種重要方式,它與生命、健康、農(nóng)業(yè)、材料和能源等領(lǐng)域密切關(guān)聯(lián)。未來的合成需要高水平的創(chuàng)造力和洞察力去探索無限可能性,讓人類在分子創(chuàng)制方面獲得更大自由。
跨越生物學(xué)與化學(xué)兩大學(xué)科的合成科學(xué),是一個(gè)有望在未來形成創(chuàng)新“核爆點(diǎn)”的領(lǐng)域。三大生命物質(zhì)合成、生物降解與轉(zhuǎn)化,乃至DNA信息存儲(chǔ)和計(jì)算等領(lǐng)域的發(fā)展,都需要生物合成與化學(xué)合成的融合。作為中國合成生物學(xué)研究的重鎮(zhèn)之一,上海應(yīng)積極作為,引領(lǐng)中國成為世界合成科學(xué)學(xué)術(shù)中心之一。
合成創(chuàng)造“影響世界的分子”
合成包括化學(xué)合成與生物合成,其目的是創(chuàng)造有功能的物質(zhì)。分子創(chuàng)制對(duì)整個(gè)人類的影響非常大,它從生命健康、農(nóng)業(yè)、材料、能源等多方面改變了人類的生產(chǎn)生活方式。
到目前為止,人類能夠合成或鑒定的分子有多少種?截至2021年5月的數(shù)據(jù)是1.5億個(gè)。根據(jù)化學(xué)空間理論預(yù)測(cè),人類能夠創(chuàng)造的分子數(shù)量有多少?答案是10的63次方!因此,人類迄今所觸及的分子合成空間,只是滄海一粟。
切莫小覷了小小的分子,一個(gè)小小的藥物分子一年銷售額可以高達(dá)200億美元,價(jià)值相當(dāng)于近200架大飛機(jī)。比如,索非布韋12周可以治愈丙肝,青蒿素讓人類不再懼怕瘧疾,而合成氨、液晶等分子的合成創(chuàng)制,更是給人類社會(huì)帶來了劃時(shí)代的影響??梢哉f,現(xiàn)代社會(huì)人類70多歲的平均壽命,與物質(zhì)的創(chuàng)造及其所帶來的技術(shù)發(fā)展為人類帶來的福祉息息相關(guān),它使我們的生命延長,也使我們的生活更便捷、更美好。
分子合成的發(fā)展,從化學(xué)角度大致經(jīng)歷了從無機(jī)到有機(jī)、從平面到立體、從小分子到大分子、從簡單到復(fù)雜的過程。未來的合成一定是精準(zhǔn)、高效和綠色的,而合成的分子一定是具有功能的。這也是為什么合成生物學(xué)從誕生之初就受到非同尋常的關(guān)注,盡管這門學(xué)科及產(chǎn)業(yè)在發(fā)展過程中還有很多極具挑戰(zhàn)的技術(shù)問題需要攻克,但它的確是人類通往未來合成與理想分子的“希望之門”。
“細(xì)胞工廠”讓物質(zhì)合成更簡單
合成科學(xué)面臨的最大機(jī)遇和挑戰(zhàn)是什么?首先是要想辦法讓分子合成變得更簡便。以復(fù)雜藥物分子為例,現(xiàn)在很多藥物分子的合成非常繁瑣,有的甚至需要經(jīng)過幾十個(gè)步驟,為此科學(xué)家正在嘗試更簡單的合成路徑。比如,通過合成生物學(xué)的途徑可以生產(chǎn)清潔燃油,用生物方法“吃掉”塑料。未來,合成生物學(xué)若能實(shí)現(xiàn)常溫常壓下人工固氮,將會(huì)對(duì)人類功莫大焉,要知道,目前工業(yè)合成氨消耗了地球上2%的能源。
由化學(xué)家創(chuàng)造的三大合成材料塑料、合成纖維、合成橡膠,結(jié)束了人類依靠天然材料的歷史,徹底改變了人類的生活方式。可以說,當(dāng)前人類的合成科技已經(jīng)達(dá)到了空前的成熟度。人類甚至一度認(rèn)為,無論多么復(fù)雜的分子,只要結(jié)構(gòu)明晰且穩(wěn)定存在、只要有充足的資源供應(yīng),就能將它合成出來。
但事實(shí)是,很多分子的合成非常困難,研發(fā)一款新藥平均需要篩選10萬個(gè)化合物、花費(fèi)超過10年時(shí)間和10億美元。能不能有更簡單的方法?新興的點(diǎn)擊化學(xué)將引領(lǐng)這一潮流,它讓分子鏈接變得像系安全帶那樣方便、精準(zhǔn),日益成為材料、制藥、生物學(xué)研究中的常用工具。
合成生物學(xué)本質(zhì)上是一個(gè)“細(xì)胞工廠”的理念,它將細(xì)胞作為一座工廠,以酶促反應(yīng)作為橋梁,在基因與最終產(chǎn)物分子結(jié)構(gòu)之間建立邏輯關(guān)聯(lián),基于細(xì)胞工廠提高產(chǎn)量,加速分子的進(jìn)化、演變和拓展應(yīng)用。它將分子合成的一道道工序都濃縮在“細(xì)胞工廠”里去完成,這就使物質(zhì)的合成變得輕而易舉。
目前,合成生物學(xué)已經(jīng)歷了20多年的快速發(fā)展。大約10年前曾有一場(chǎng)激烈論戰(zhàn),探討合成生物學(xué)與合成化學(xué)誰更具優(yōu)勢(shì)。與化學(xué)合成相比,合成生物學(xué)有其獨(dú)到的優(yōu)勢(shì),例如中間體無需純化、不需要保護(hù)基、高立體選擇性、利用可再生資源等?,F(xiàn)在看來,它們最終一定會(huì)走向交叉融合,讓我們實(shí)現(xiàn)創(chuàng)造物質(zhì)的自由。無論是在細(xì)胞工廠還是在真實(shí)的工廠中合成物質(zhì),人們總希望它具有定量的收率、完美的選擇性且沒有廢物產(chǎn)生,歸結(jié)到最基礎(chǔ)的科學(xué)問題,仍然是化學(xué)鍵的活化、斷裂和重組。
抓住機(jī)遇搶占合成科學(xué)制高點(diǎn)
隨著化學(xué)和生物學(xué)的發(fā)展與技術(shù)進(jìn)步,化學(xué)合成與生物合成出現(xiàn)了由點(diǎn)到面的快速融合、相互促進(jìn)的趨勢(shì),為合成科學(xué)帶來了前所未有的創(chuàng)新機(jī)遇。未來的合成科學(xué)應(yīng)以功能分子創(chuàng)制為導(dǎo)向,以合成化學(xué)與合成生物學(xué)為綱,尋求二者從理論到技術(shù)的全方位深度融合,突破傳統(tǒng)的學(xué)科研究范式,拓展合成科學(xué)發(fā)展的新空間,由此構(gòu)建我國在合成科學(xué)領(lǐng)域的新格局,在把握新一輪科技革命和產(chǎn)業(yè)革命重大機(jī)遇的同時(shí),搶占未來合成科學(xué)領(lǐng)域的制高點(diǎn)。
上海在合成生物學(xué)領(lǐng)域有著自己的優(yōu)勢(shì),我們沒有理由不把它做好。例如在青蒿素的合成上,目前僅通過合成生物學(xué)途徑只能到青蒿酸。上海交通大學(xué)通過合成生物學(xué)與合成化學(xué)的融合,再用兩步化學(xué)合成,就可以將青蒿酸變成青蒿素。目前團(tuán)隊(duì)得到的青蒿素結(jié)晶純度為65%,未來能不能做到80%或更高?能不能把成本降到每千克1000元以下?如果能夠做到,那我們就沒有必要再去種青蒿來提取青蒿素了。目前,該項(xiàng)目正與藥企推進(jìn)產(chǎn)業(yè)化。
除了青蒿素的人工合成,上海交通大學(xué)還用合成生物學(xué)方法,實(shí)現(xiàn)了從淀粉糖、纖維素糖到乳酸的高效合成,并取得了核心專利,后續(xù)可通過化學(xué)合成將乳酸轉(zhuǎn)化為生物可降解材料聚乳酸,目前正在牽手企業(yè)推動(dòng)產(chǎn)業(yè)化。最近,我們還運(yùn)用合成生物學(xué)方法,實(shí)現(xiàn)了從二氧化碳直接合成聚乳酸方面的“從0到1”的突破。未來,這些都將是巨大的產(chǎn)業(yè),當(dāng)成本下降到一定程度后,人類目前面臨的白色污染問題將得到有效解決。
合成生物學(xué)與合成化學(xué)的交叉融合,將會(huì)是一個(gè)長期促進(jìn)的過程。合成生物學(xué)家應(yīng)該增強(qiáng)對(duì)生物合成反應(yīng)機(jī)制的深層次認(rèn)知,包括酶的結(jié)構(gòu)與催化功能的關(guān)系、酶的動(dòng)態(tài)催化機(jī)制、生物轉(zhuǎn)化的化學(xué)原理和復(fù)雜分子的生物合成策略等;化學(xué)家應(yīng)該學(xué)習(xí)和模擬生物體系的能量和物質(zhì)的轉(zhuǎn)化機(jī)制,構(gòu)筑高效的仿生催化劑和人工酶,發(fā)展高效的仿生反應(yīng),實(shí)現(xiàn)各種功能分子的高效、精準(zhǔn)創(chuàng)造。與此同時(shí),我們尤其需要通過生物合成與化學(xué)合成的融合,聚焦具有重大戰(zhàn)略價(jià)值的合成轉(zhuǎn)化和功能分子,對(duì)接醫(yī)藥、材料、能源、健康、碳中和、人工固氮等重大產(chǎn)業(yè)和社會(huì)問題,解決單一合成手段無法解決的挑戰(zhàn)性難題。
展望未來,化學(xué)合成與生物合成的交叉研究,還將加深人類對(duì)生命和自然的認(rèn)識(shí),有助于我們從新的角度去思索地球演化、環(huán)境失衡、生命進(jìn)化及健康和疾病等基礎(chǔ)問題,提出創(chuàng)造性的解決方案。
作者:丁奎嶺(許琦敏根據(jù)報(bào)告整理)
編輯:許琦敏
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